Een waterfilter is onmisbaar voor het aquarium. Met een binnenfilter aquarium zorg je ervoor dat je aquarium schoon blijft. Een binnenfilter wordt het meeste gebruikt in kleinere aquaria. Het voordeel van een binnenfilter is dat er geen water lekkage kan optreden. Een ander groot voordeel is ook zeker dat een binnenfilter altijd minder lawaai maakt dan een buitenfilter. Wat zeker mooi mee genomen is dat een binnenfilter aquarium minder stroom verbruikt dan een buitenfilter.

Helaas heeft een binnenfilter aquarium ook nadelen, namelijk de inhoud van je aquarium wordt minder, daarnaast is het schoonmaken lastiger, al zijn er nieuwe binnenfilters gemaakt welke dat probleem al een stuk hebben opgelost, nameijk de EHeim Binnenfilter Pickup, deze binnenfilter is zo gemaakt dat je de cartridge er makkelijk uit kan halen en de pomp blijft zitten, filtermateriaal vervangen en terug plaatsen. Het feit blijft dan nog steeds dat een binnenfilter aquarium moeilijk aan het gezicht te ontrekken is.